エクセレントゼミナールには、2つの通常コース(エクセレントコースとスタンダードコース)と個別指導コースがあります。
　 エクセレントコースは、難関私立中受験生と有名私立中に通う生徒のためのコース。 予習シリーズやプログレス、シリウスなどの教材を使って、私立の進度に合わせて授業を進めます。
　 スタンダードコースは、難関私立・公立高校合格を目標とする中１〜中３のためのコース。 新小学問題集や新中学問題集を基本テキストとして、公立の進度に合わせて授業を進めます。
　 個別指導コースは、四谷大塚・ＳＡＰＩＸ・日能研などの大手進学塾のテキスト準拠指導や 通常のカリキュラムからはずれる特別指導が必要な生徒に合わせた個人指導を行います。